期刊简介
本刊宗旨是防止传染病的传入传出，保护人体健康，为维护口岸食品安全促进国际贸易与友好往来，发展社会主义经济服务。
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首页>中国国境卫生检疫杂志
- 杂志名称：中国国境卫生检疫杂志
- 主管单位：国境卫生检疫
- 主办单位：国家质量监督检验检疫总局
- 国际刊号：1004-9770
- 国内刊号：11-3254/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中华预防医学会优秀期刊进步奖（00）期刊收录：国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美), 维普收录(中)
应用一致-简并引物RT-PCR检测手足口病患者粪便肠道病毒
胡群；倪红霞
关键词：肠道病毒, 手足口病, 粪便, 一致-简并引物
摘要：目的 探讨一致-简并引物RT-PCR对手足口病患者粪便中肠道病毒的检测效果.方法 根据GenBank中不同肠道病毒属病毒的多聚蛋白氨基酸序列,利用一致-简并引物(CODEHOP)设计程序设计合成1对简并引物,用一步RT-PCR法对20份手足口病患者粪便样本提取的RNA进行扩增,扩增产物测序后,用BLAST同源性比对初步确定基因型别,再与不同流行株进行遗传进化分析.结果 20份样本RT-PCR检测结果均为阳性,11份样本与肠道病毒EV71型(Enterovirus,EV71)同源性高达97％,与EV71病毒的6个流行株位于同一分支,遗传距离为0.031～0.037;7份样本与柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus,CoxA16)同源性高达99％,与CoxA 16病毒的6个流行株位于同一分支,遗传距离为0.010～0.028;2份样本与CoxA10同源性高达99％,与CoxA10病毒的6个流行株位于同一分支,遗传距离为0.024～0.053.结论 肠道病毒属一致-简并引物RT-PCR方法可以用于手足口病患者感染肠道病毒检测与分型.
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